Fenerbahçe'nin Avrupa kupalarındaki başarımı şöyle:
| Organizasyon | O | G | B | M | A | Y |
| UEFA Kupası | 54 | 18 | 10 | 26 | 72 | 91 |
| UEFA Avrupa Ligi | 104 | 50 | 31 | 23 | 148 | 107 |
| Avrupa Şampiyon Kulüpler Kupası | 33 | 9 | 4 | 20 | 30 | 70 |
| UEFA Şampiyonlar Ligi eleme | 46 | 18 | 14 | 14 | 67 | 52 |
| UEFA Şampiyonlar Ligi | 40 | 11 | 6 | 23 | 42 | 70 |
| Avrupa Kupa Galipleri Kupası | 9 | 3 | 1 | 5 | 11 | 11 |
| UEFA Konferans Ligi | 18 | 12 | - | 6 | 44 | 23 |
| TOPLAM | 304 | 121 | 66 | 117 | 414 | 424 |
